Régészeti Múzeum
Az itt kiállított több mint 400.000 tárgy már önmagában is elég hatásos lenne, de a fényekkel és az elrendezéssel kombinálva a Régészeti Múzeum még tovább képes fokozni az élményt. Az intézmény elődje a Nemzeti Múzeum volt, amit 1846-ban nyitottak meg. A régészeti részleg 1876-ban lett önálló, ekkor született meg a zágrábi Régészeti Múzeum, ami 1880-1945-ig az Akadémia épületében működött. Ezt követően költöztették át jelenlegi helyére a Vranyczany-Hafner kúriába. Nem csak a Horvátország, de a szomszédos országok, a mediterrán vidékek és Egyiptom területén feltárt leletek is láthatók itt. Gazdag numizmatikai, őskori, ókori és egyiptomi gyűjteményt nézhetnek meg a látogatók medálokkal, ősi kozmetikumokkal, kerámiákkal és a híres zágrábi múmiával együtt. A múzeum kertjében található a Lapidarium több száz római kori emlékkel.
Iparművészeti Múzeum
1880-ban a Művészeti Társaság és az akkori elnök, Izidor Krsnjavi alapították a múzeumot azzal a céllal, hogy az egyre inkább elhatalmasodó és az élet minden területére kiható iparosítással szemben megvédjék a hagyományos kézműves termékeket. A több mint 160.000 kiállítási tárgy 19 különböző kategóriába tartozik, mint a lakberendezés, fotózás, festészet, szobrászat, órák, hangszerek, játékok. A múzeum könyvtára 50.000 kötettel, folyóiratokkal és korai nyomatokkal külön figyelmet érdemel. Állandó kiállításait több mint 2000 m2-en, három szinten lehet megtekinteni a legkülönbözőbb időszakokból, a gótikustól az art decoig. A kiállított tárgyak a 4-20. századból származnak, közülük a legelsőket tehetős horvát arisztokraták és műgyűjtők adományozták az intézménynek.
Iskola Múzeum
A horvát oktatási rendszer fejlődését lehet nyomon követni a múzeumban a kezdetektől egészen napjainkig. A Horvát Pedagógiai és Irodalmi Társaság megszerveződése, 1871 óta folyamatosan gyűjtötte az oktatáshoz kapcsolódó anyagokat a leendő múzeumhoz. 1889-ben a gyűjtemény az újonnan épített Tanárotthonban kapott helyet. A múzeum megnyitására 1901 augusztusában került sor. A kiállítások egyformán érdekesek a felnőttek és a gyerekek számára, bemutatják a régen használt oktatási eszközöket, segédleteket, iskolai felszereléseket, könyveket, a büntetési és fegyelmezési módszereket, tankönyveket, ugyanakkor látható számos fénykép és dokumentum a múltból.
Vasúti Múzeum
A zágrábi Vasúti Múzeum nemzeti jelentőséggel bír, tevékenységi körébe tartozik az 1890-es évektől kezdve gyártott vasúti járművek beszerzése, megőrzése, védelme és bemutatása. A múzeumot 1991-ben alapították, rajta keresztül szépen végig lehet követni a horvát vasút fejlődését a 19. század második felétől a jelenkorig bezárólag. Hat különálló kiállítás mutatja be a vasúti szerelvényeket, az alkatrészeket, a gépeket, berendezéseket, az egyenruhákat, személyes iratokat és a vasút által használt telekommunikációs eszközöket. A múzeumban 36 gőzmozdony látható az 1891-1961. közötti időszakból, dízel- és villamosmozdonyok, vagonok és más vasúti járművek. Egy postakocsit teljes egészében felújítottak, kiállításokhoz és előadásokhoz használják. A Vasúti Múzeum legöregebb darabja egy Budapesten gyártott, 1891-es Katica nevű gőzmozdony, ami 1972-ig üzemelt.
Zágrábi Városi Múzeum
A klarisszák 17. századi kolostorában kialakított Városi Múzeum az őskortól napjainkig ismerteti meg a horvát főváros történetét a látogatókkal. 1907-ben alapították és helyezték el a műemlék épületegyüttesben, több mint 75.000 darabos kiállításai politikai, gazdasági, művészeti és kulturális szempontból is bemutatják Zágráb múltját, láthatók itt a Gric-hegyen feltárt, 7. századi hallstatti település romjai, Zágráb középkori városának makettje és a II. János Pál pápa 1994-es zágrábi látogatásáról készült fotók is. A kiállítások jelentős része interaktív formában is megtekinthető, ezért gyerekkel is érdemes ellátogatni ide.
Horvát Sportmúzeum
A Sportmúzeum története több mint 100 évre nyúlik vissza, amikor egy elkötelezett csapat elhatározta, hogy összegyűjt mindent, ami a sporthoz és annak megszületéséhez, történetéhez kapcsolódik. A múzeum bemutatja, hogy az egyes sportágak mikor és hogyan terjedtek el Horvátországban, felvonultatják a legrangosabb hazai és nemzetközi versenyeken elért eredményeket, láthatók régi sporteszközök, érmék, trófeák és a nemzet legnagyobb sportolóit is megismerhetjük.