1999-ben újították fel a medencéket és ekkor építették ki a szűrőforgató-berendezéseket is. Élménymedencéje nyakzuhannyal, sodrófolyosóval, ülőpadokba rejtett hátmasszírozó vízsugárral, víz alatti pezsegtetéssel és egyéb különleges funkciókkal várja a fürdőzőket.
Budapest legmelegebb vízű, egyben legmélyebb forrása 74-75 Celsius-fokos. A fürdő vízét az 1938-as II. számú Szent István-kút, hidegvizét 6 kiseb kút adja.
A Széchenyi Gyógyfürdő vize szulfátos, kálcium-magnézium-hidrogénkarbonátos hévíz, mely jelentős mértékben tartalmaz fluoridot és metaborsavat.
Az ivókút víze kloridos, szulfátos, kálcium-magnézium-hidrogénkarbonátos gyógyvíz, melyben nagy mennyiségű fluorid és alkáliák találhatók.